Theo một số đánh giá, bài hát "Mùa hoa phượng nở" là một trong những "bài hát hay" dành cho thiếu nhi về mùa hè trong rất nhiều các bài hát cho tuổi học trò.[2] Việc Hoàng Vân đưa những sự tìm tòi, sáng tạo vào ca khúc không chỉ để làm cho âm nhạc "mới lạ" mà còn để "gây cảm xúc cho người nghe".[6] Bài hát có tác động nhất định đến tuổi thơ của trẻ em Việt Nam trong khoảng cuối thế kỷ 20, và được bình chọn vào danh sách "50 bài hát thiếu nhi Việt Nam hay nhất thế kỷ XX" do báo Thiếu niên Tiền Phong tổ chức.[7][8] "Mùa hoa phượng nở" cũng được đưa vào chương trình giảng dạy thêm trong sách Âm nhạc 5 của Bộ Giáo dục và Đào tạo Việt Nam xuất bản trong chương trình giáo dục phổ thông 2006.[9]